Grupos de investigación

Grupos de investigación

Bioquímica, Proteómica y Biología de Sistemas Vegetal y Agroforestal | AGR-164 | UCO



Código: AGR-164
Miembros: Coinciden con los datos existentes en el Servicio de Información Científica de Andalucía (SICA).

Responsable : JESÚS VALENTÍN JORRIN NOVO

Teléfono: 957218439

Email: bf1jonoj@uco.es
Web: http://www.uco.es/probiveag/

Organismo: UCO
Departamento: Bioquímica y Biología Molecular
Dirección Postal: Universidad de Córdoba, Campus de Rabanales, Edificio Severo Ochoa, planta baja. 14071-Cordoba

Líneas de Investigación:
– Análisis de proteomas vegetales. Modificaciones postgraducionales. Proteoma redox
– Aspectos moleculares relacionados con embriogénesis y respuesta a estreses bióticos y abióticos en plantas (hongos, plantas parásitas, sequía)
– Bioquímica y biología molecular vegetal y agroforestal
– Caracterización de alérgenos y trazabilidad alimentaria
– Genómica funcional
– Análisis funcional de genes y proteínas mediante complementación heteróloga en arabidopsis thaliana
– Metabolismo secundario de plantas (compuestos fenólicos y otros)
– Metabolómica. Metabolismo secundario, compuestos fenólicos, terpenoides. Proteoma de levaduras
– Proteómica en bacterias patógenas Grampositivas: vacunas, diagnóstico y nuevos antimicrobianos
– Proteómica, otras aproximaciones
– Ómicas y biología de sistemas vegetal y afroforestal (plantas, hongos fitopatógenos, levaduras)
– Reacciones de plantas a arsénico y metales pesados y su aplicación en fitorremediación y como marcadores de contaminación ambiental
– Reacciones defensivas y de resistencia a estreses bióticos (patógenos) y abióticos (sequía). Factores de patogenicidad
– Compuestos fenólicos y otros metabolitos secundarios de plantas: metabolismo y papel biológico y ecológico. Reacciones defensivas de plantas a plantas parásitas (sistemas modelos: interacciones girasoljopo y leguminosasjopo). •Transcripción, marcadores moleculares de DNA

Proyectos y convenios investigación y agroalimentación:
– CARACTERIZACIÓN DE GENES DE ENCINA IMPLICADOS EN LA RESPUESTA A ESTRESES Y ACTIVACIÓN DE MECANISMOS DE DEFENSA PARA SU USO EN MEJORA FRENTE A LA SECA Y CAMBIO CLIMÁTICO (ENCINÓMICA-3). Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad Convocatoria 2022. Ministerio de Economía y Competitividad. IPs: María Ángeles Castillejo Sánchez y María Dolores Rey Santomé 2023-2025
– MEJORA DE LA ENCINA (Quercus ilex) Y SELECCIÓN DE GENOTIPOS ÉLITES RESILIENTES A LA SECA, CAMBIO CLIMÁTICO Y PARA SU USO EN ALIMENTACIÓN HUMANA, ASISTIDA POR TÉCNICAS DE GENÓMICA Y METABOLÓMICA. Ayudas a proyectos de excelencia en el ámbito del Plan Andaluz de Investigación, Desarrollo e Innovación (PAIDI) 2021. Junta de Andalucía. IPs: María Ángeles Castillejo Sánchez y María Dolores Rey Santomé
– SELECCIÓN ASISTIDA POR MARCADORES MOLECULARES DE GENOTIPOS ÉLITE Y TRATAMIENTO CON ACTIVADORES DE DEFENSA: DOS APROXIMACIONES BIOTECNOLÓGICAS AL PROBLEMA DE LA SECA EN ENCINA (ENCINOMICA-2). Programa Estatal de I+D+i Orientada a los Retos de la Sociedad. Convocatoria 2019. Ministerio de Economía y Competitividad. IPs: Jesús V. Jorrín Novo, María Ángeles Castillejo Sánchez. 2020-2023.
– BÚSQUEDA DE MARCADORES MOLECULARES DE RESPUESTA Y RESISTENCIA/TOLERANCIA A Phytophthora cinnamomi EN Quercus ilex Y Quercus suber. REF.: TSA0068235. Grupo TRAGSA. Ministerio de Agricultura, Pesca y Alimentación. Área de Recursos Genéticos Forestales. Subdirección General de Política Forestal. IPs: Jesús V. Jorrín Novo, María Dolores Rey Santomé.
– LA SECUENCIACIÓN DEL GENOMA DE LA ENCINA (Quercus ilex) Y LA BÚSQUEDA DE GENES DE RESPUESTA A ESTRESES ASOCIADOS AL SÍNDROME DE LA SECA: CARACTERIZACIÓN ESTRUCTURAL Y FUNCIONAL. Convocatoria de ayudas a proyectos de I+D+i. Convocatoria 2020. Programa operativo FEDER Andalucía 2014-2020. IPs: María Dolores Rey Santomé y Jesús V. Jorrín Novo.

Publicaciones:
– Pérez Mora, W.H., Castillejo, M.A., Jorrín Novo, J.V., Melgarejo, L.M., Ardila, H.D. (2023) Thiamine-induced resistance in carnation against Fusarium oxysporum f. sp dianthi and mode of action studies based on the proteomics analysis of root tissue. Scientia Horticulturae. Aceptado.
– Rodríguez de Francisco, L. E., Carreras-De León, R., Navarro Cerrillo, R. M., Paulino-Gervacio, L. A., Rey, M. D., del Orbe Matos, D., … & Jorrín Novo, J. V. (2022). Population genetic structure and dispersal of Pinus occidentalis in the Dominican Republic by chloroplastic SSR, with implications for its conservation, management, and reforestation. Canadian Journal of Forest Research, 52(4), 553-560.
– Salas-Moreno, M., Castillejo, M. A., Lopez-Hidalgo, C., Marrugo-Negrete, J., Rodriguez-Cavallo, E., Mendez-Cuadro, D., & Jorrin-Novo, J. (2022). LC-MS/MS shotgun proteomics reveals biochemical mechanisms of Paspalum fasciculatum tolerance to Pb-stress. BIOLOGIA PLANTARUM, 66, 188-200.
– Salas-Moreno, M., Castillejo, M. A., Rodríguez-Cavallo, E., Marrugo-Negrete, J., Mendez-Cuadro, D., & Jorrin-Novo, J. (2022). Proteomic changes in Paspalum fasciculatum leaves exposed to Cd stress. Plants, 11: 2455.
– Guerrero-Sánchez, V. M., López-Hidalgo, C., Rey, M. D., Castillejo, M. Á., Jorrín-Novo, J. V., & Escandón, M. (2022). Multiomic Data Integration in the Analysis of Drought-Responsive Mechanisms in Quercus ilex Seedlings. Plants, 11: 3067.
– Ogawa, M., Carmona-Jiménez, P., García-Martínez, T., Jorrín-Novo, J. V., Moreno, J., Rey, M. D., & Moreno-García, J. (2022). Use of yeast biocapsules as a fungal-based immobilized cell technology for Indian Pale Ale-type beer brewing. Applied Microbiology and Biotechnology, 1-11.
– González-Guzmán, A., Rey, M. D., Froussart, E., & Quesada-Moraga, E. (2022). Elucidating the effect of endophytic entomopathogenic fungi on bread wheat growth through signaling of immune response-related hormones. Applied and Environmental Microbiology, 88(18), e00882-22.
– Escandón, M., Bigatton, E. D., Guerrero-Sánchez, V. M., Hernández-Lao, T., Rey, M. D., Jorrín-Novo, J. V., & Castillejo, M. A. (2022). Identification of proteases and protease inhibitors in seeds of the recalcitrant forest tree species Quercus ilex. Frontiers in Plant Science, 13.
– Tienda-Parrilla, M., López-Hidalgo, C., Guerrero-Sanchez, V. M., Infantes-González, Á., Valderrama-Fernández, R., Castillejo, M. Á., … & Rey, M. D. (2022). Untargeted MS-based metabolomics analysis of the responses to drought stress in Quercus ilex L. leaf seedlings and the identification of putative compounds related to tolerance. Forests, 13(4), 551.
– San-Eufrasio, B., Castillejo, M. Á., Labella-Ortega, M., Ruiz-Gómez, F. J., Navarro-Cerrillo, R. M., Tienda-Parrilla, M., … & Rey, M. D. (2021). Effect and response of Quercus ilex subsp. ballota [Desf.] Samp. seedlings from three contrasting Andalusian populations to individual and combined Phytophthora cinnamomi and drought stresses. Frontiers in Plant Science, 12, 722802.
– Amaral, J., Lamelas, L., Valledor, L., Castillejo, M.A., Alves, A., Pinto, G. 2021. Comparative proteomics of Pinus-Fusarium circinatum interactions reveal metabolic clues to biotic stress resistance. Physiologia Plantarum, 173:2142-2154.
– Chalbi, A., Sghaier-Hammami, B., Baazaoui, N., Hammami, S. B., Hatem, B. J., Garcia-Caparros, P., … & Abdelly, C. (2021). Comparative study of the effect of salt stress, Alternaria alternata attack or combined stress on the Cakile maritima growth and physiological performance. Notulae Botanicae Horti Agrobotanici Cluj-Napoca, 49(3), 12446-12446.
– Castillejo, M.A., Villegas-Fernández, A., Hernandez-Lao, T., Rubiales, D. 2021. Photosystem II repair cycle in faba bean may play a role in its resistance to Botrytis fabae infection. Agronomy, 11, 2247.
– Morales, C. J., de Francisco, L. E. R., Hidalgo, C. L., Cerrillo, R. M. N., Perdomo, O. P., & Novo, J. V. J. (2021). Endemic Juniperus gracilior varieties of the Hispaniola island, tree taxa of environmental and economic relevance and a valuable phytochemical source. Bosque, 42, 7-22.
– Tartaglia, M., Sciarrillo, R., Zuzolo, D., Amoresano, A., Illiano, A., Pinto, G., … & Guarino, C. (2021). Why consumers prefer green friariello pepper: changes in the protein and metabolite profiles along the ripening. Frontiers in Plant Science, 12, 668562.
– Valero-Galván J, González-Fernández R, Jorrín-Novo JV. 2021. Interspecific variation between the American Quercus virginiana and Mediterranean Quercus species in terms of seed nutritional composition, phytochemical content, and antioxidant activity. Molecules 26:2351.
– Sánchez‑Rodríguez AR, Rey MD, Nechate‑Drif H, Castillejo-Sánchez MA, Jorrín‑Novo JV, Torrent J, del Campillo MC, Sacristán D. 2021 Combining P and Zn fertilization to enhance yield and grain quality in maize grown on Mediterranean soils. Scientific Reports 11:7427
– San-Eufrasio B, Bigatton ED, Guerrero-Sánchez VM, Chaturvedi P, Jorrín-Novo JV, Rey MD, Castillejo-Sánchez MA. 2021. Proteomics data analysis for the identification of proteins and derived proteotypic peptides of potential use as putative drought tolerance markers for Quercus ilex. International Journal of Molecular Sciences 22:3191
– Escandón M, Jorrín-Novo JV, Castillejo-Sánchez MA. 2021. Application and optimization of label-free shotgun approaches in the study of Quercus ilex. Journal of Proteomics 233:104082.
– Sghaier-Hammami B, Castillejo-Sánchez MA, Baazaoui N, Jorrín-Novo JV, Escandón M. 2021. GeLC-Orbitrap/MS and 2-DE-MALDI-TOF/TOF comparative proteomics analysis of seed cotyledons from the non-orthodox Quercus ilex tree species. Journal of Proteomics 233:104087
– Kulak M, Jorrín-Novo JV, Romero-Rodríguez MC, Yildirim ED, Gul F, Karaman S. 2021. Seed priming with salicylic acid on plant growth and essential oil composition in basil (Ocimum basilicum L.) plants grown under water stress conditions. Industrial Crop & Products 161:113235
– Rey MD, Ramírez C, Martín AC. 2021. Wheat, Rye, and Barley Genomes Can Associate during Meiosis in Newly Synthesized Trigeneric Hybrids. Plants 10:113.

Master y Doctorado:
Máster en Biotecnología Agroalimentaria y Forestal.
Propusta de Proyecto (2017)

Equipos y técnicas instrumentales avanzadas de las que dispone el grupo:
– Técnicas de estudio de proteínas: proteómica. Extracción, separación (electroforesis, cromatografía) y caracterización e identificación (western, espectrometría de masas). Manejo de herramientas informáticas de análisis estadístico, de datos de espectrometría de masas, de búsqueda en bases de datos.
– Técnicas de biología molecular: extracción y análisis de DNA y RNA, separación electroforética, PCR, marcadores moleculares de DNA, transcriptómica (Northern blot, RT-PCR cuantitativa), secuenciación, clonación y tranformación, mutagénesis dirigida. Expresión y complementación heteróloga de proteinas.
– Técnicas para el análisis metyabolómico. LC y GC-MS.
– Técnicas clásicas de bioquímica: análisis de metabolitos (carbohidratos, metabolitos secundarios) y actividades enzimáticas. Centrifugación, cromatografía (capa fina, líquida, FPLC, HPLC), espectrofotometría UV-visible, fluorimetría.
– Técnicas de ecofisiología. Fotosíntesis (índice SPAD, fluorescencia, intercambio gaseoso), régimen y estado hídrico (potencial hídrico, osmótico).
– Cultivo in vitro de células y tejidos vegetales.
– Análisis bioinformático aplicado a las técnicas –ómicas y biología de sistemas. Análisis estadístico e integración de datos.

Líneas Estratégicas:
Por lo que en la actualidad hace referencia a mi grupo nuestro esfuerzo va dirigido a especies forestales, y más concretamente a especies de la dehesa andaluza. No es necesario hacer énfasis en su importancia económica y medioambiental, con problemas a resolver y la “amenaza” de los posibles efectos del cambio climático. Hoy en día existe una ley para la dehesa y se habla de la creación de un centro para la dehesa en el que, de ser realidad, la UCO debería implicarse. La investigación forestal está muy desatendida y no hay muchos grupos a nivel nacional o internacional, por lo que podríamos tener perfectamente cabida. En el grupo de especies forestales, y dadas sus caractyerísrticas comunes, podríamos incluir especies frutales.

Líneas temáticas:
– Mejora, Producción y Protección Vegetal



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